Nvidias Tesla-GPUs helfen BGI bei Genomanalyse

Beim weltgrößten Genom-Institut BGI kommen jetzt Nvidias Tesla-GPUs zum Einsatz, um die großen Datenmengen zu bewältigen. Eine Datenanalyse, die vorher vier Tage in Anspruch nahm, ist nun in sechs Stunden möglich - das spart Zeit und Geld.

Durch den Einsatz einer auf Nvidias Tesla-GPUs basierten Server-Farm konnte das weltweit größte Genom-Institut BGI jetzt die Analyse einer sehr großen Datenmenge von DNA-Sequenzen erheblich verkürzen. Wie aus einer Pressemitteilung von Nvidia hervorgeht, verrichteten die Tesla-Prozessoren ganze Arbeit. Die normalerweise vier Tage andauernde Datenanalyse konnte nun in nur sechs Stunden durchgeführt werden.

Diese Beschleunigung wird als ein entscheidender Schritt gewertet, da die bisher kostenintensive weil zeitaufwändige Bestimmung der chemischen Zusammensetzung eines DNA-Moleküls zukünftig auf eine wesentlich kosteneffektivere Art und Weise vollzogen werden kann. Dr. Bingqiang Wang, Leiter des High Performance Computing von BGI, erklärte, dass es eine wahre Flut an Genom-Daten zu bewältigen gäbe, die durch die für die Hochdurchsatz-Sequenzierung verantwortlichen Maschinen täglich entstünde. Mittels der Genom-Daten-Analyse produzierten Daten erhalten Wissenschaftler Einblicke in die Welt der Bakterien, Pflanzen und letztlich auch der Menschen. Die gewonnenen Erkenntnisse bilden jeweils die Fundamente für Forscher und Ärzte darauf aufbauend noch effektivere Medikamente und Behandlungsmethoden zu entwickeln. Dank der Möglichkeit die chemische Zusammensetzung der DNA-Moleküle nun kostengünstiger bestimmen zu können, profitieren letztlich die Patienten, da sie für das jeweilige Medikament bzw. die notwendige Behandlungsmethode am Ende auch erheblich weniger (zu)zahlen müssen.