Also ich wuerde dir folgenden Systementwurf empfehlen.
1 * kleine Festplatte, SATA fuer OS
2 * Festplatte, moeglichst groß, an SATA fuer die Daten. (RAID 1 oder RAID 0/ JBOD) RAID 5 usw kannst du dir schenken, dafuer reicht dein Budget nicht/ die Leistung des Atom nicht. Budget weil du dafuer einen Host-Adapter benoetigst.
ION Board mit 330iger CPU. Schnellerer RAM = mehr Speed. Besonders wegen Netzwerk/ Festplatten I/O wirst du das zu schaetzen lernen.
Das RAID laesst sich unter Windows einfach in der Datentraegerverwaltung erstellen. Die zwei Platten einfach in Dynamische Datentraeger umwandeln und dann zusammenfassen. Voila.
Da du dann bei dem Mainboard einen PCI oder PCIe Steckplatz frei hast, weil du den SATA Controller nicht brauchst, steckst du eine Intel Netzwerkkarte rauf. Mit der Karte erreichst du den bestmoeglichen Durchsatz bei dem Atom. Bei Gigabit LAN wird er zwar auch je nach OS bei 25(XP) - 60MByte/s (Linux/Win7) die Sekunde rumkrepeln. Mit nem Realtek wird er aber schon bei 10MByte/s auf Anschlag gehen.