SP3 Neuinstallation mit zwei Windows auf dem PC!

Hallo,
ne kleine Frage, müßte windows xp sp3 neu installieren, dummerweise hab ich zwei Installationen auf meinem Rechner.
Bei mir siehts so aus:
Festplatte A)
C) normales Win OS -primary aktiv
F  sound Win OS -primary
D  daten -logisch
Festplatte B)
G  daten
H  daten

Mein normales OS müßte ich mal neu machen, daß ist ganz schön langsamer geworden, hab aber angst.
Ob ich danach noch auf mein zweites OS zugreifen kann. Der MBR wird ja überschrieben. Kann ich jetzt meine bootini kopieren und später einfach ersetzen und dann wieder ganz normal auf meine beiden OS zugreifen?